影片中，火星人在火星灭绝之时，向外太空（通过影片显示他们有能力飞的远远大于银河系）发射无数飞船撤离，其中有一艘奔向了地球，把基因带到了地球，才有了地球生物的进化。
但是，既然火星人早就有能力很轻松地飞往外太空，地球肯定早就被他们探索遍了，也肯定做过比（无数类似地球人登录火星然后种植藻类培养细菌）这种还高级的把戏。
所以怎么会因为是火星人逃难之际才向地球发射了基因火种呢？
除此之外，火星人真存在的话，以影片中显示的火星高级文明，怎么不会有那种围绕太阳系内各星球的火星人造卫星（类似地球人的）的残骸漂浮在宇宙中。还有火星人遍布太阳系的建筑等等，从来没被发现过。这些我感觉都是电影的硬伤啊。
而且，即使火星人最后逃难时，也应该留下一些证明存在的印记，肯定不单单在火星一个星球上，银河系内的星球应该都有。（当然，这可能与三体中的黑暗森林理论相悖，但既然火星人都在火星上留下了印记，没道理不以很轻松的代价在其他星球留下印记啊）。
（这一条需要比较专业的地质学家解读，我是猜想）再者，火星毁灭之时，电影里的全息影像显示地球已经处于较稳定状态，只是在板块漂移阶段的初期，但是很多绿植，海洋，蓝天白云通过地球全图都能看到了，有了一套含氧气的生态系统存在，为什么没有火星人在地球定居或活动？实际上又回到了我所说的第一条了。
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