莲叶童子和花店的三姐妹

旅行的途中，小智等人在歇息的湖边结识了「浮萍神奇宝贝」莲叶童子与花店三姐妹典子、玲子、奈绪子。一行人拜访他们的店铺﹑享用好吃的果子料理、热烈谈论起对神奇宝贝有各种效果的果实。三姐妹中最年幼的奈绪子似乎喜欢上了小刚。由于小刚一句想看看果实中少见的香柚之果，奈绪子竟然独自到森林里去寻找！森林天黑后容易迷路。小智等人急忙出发去寻找奈绪子，但是偏偏这个时候火箭队想要捕抓这些莲叶童子，小智他们能保护湖泊的和平吗？