爱哭树国王与魔尼尼皇后!?

海上之旅结束，小智等人来到港口城市，在那里差点被火箭队的人设计抢走神奇宝贝。小卡比兽的绝招「挥指功」使得一伙人勉强脱离危机，但是在混乱之中，皮卡丘、喵喵、爱哭树、魔尼尼却走失了。小智一行人跟火箭队都拼命地在寻找走失的同伴。这时在他们面前出现了魔尼尼与爱哭树。不知为什么，两只神奇宝贝的样子却不太对劲……