正电拍拍与负电拍拍，山上的灯塔

以紫堇市为目的地而前进的小智等人，在浓雾的山路中行走着。听说山中有个村子，在那里，有着被当成路标的灯塔。小智等人遇到了守护灯塔的「光之石」的正电拍拍与负电拍拍，其主人和智见到小智的打扮，认定他就是村子传说中的勇者。和智完全没有战斗经验，他带着加油神奇宝贝跟随自己崇拜的小智一起练习。谁知火箭队却跑来捣蛋，抢走了光之石与皮卡丘…