葛藤

由于一种异生物的出现，导致太阳系被破坏，如今只剩下一小部分的人类还存活着。他们为了生存，制作了如同小行星般巨大的宇宙播种船希德尼娅，并在宇宙中进行旅行。播种船希德尼娅一边同毁灭了太阳系的神秘生命体·奇居子交战，一边向新天地进发。

取得辉煌战果的卫人操纵士·谷风长道，成为了操纵士训练生们憧憬的对象。但他本人所关心的只有自外生研消失的胞衣星白的去向而已。另一方面，辞去卫人操纵士的岐神海苔夫，拜访了科学家落合的研究所。在这被封印的场所，岐神所见到的是……

经过了1000年后，时值希德尼娅出航纪元1009年，由地下层部培育的少年谷风长道自祖父死后而来到上层市区。并入学巨大人型兵器“卫人”的操控师训练学校，这也是谷风长道首次与外界人接触。

谷风长道，曾与爷爷两人一同居住在希德尼娅最下层(地下)。在爷爷死後经过3年，储藏的粮食已经一无所剩，因此违背爷爷的遗言来到上层部。上层部是与无人的下层部迥然不同的居住区，长道因为从粮食库中偷米而遭到逮捕。随後在希德尼娅舰长的庇护下，成为卫人操纵士的第628期训练生。出生等相关来历被当作极机密处理，只有极少部份的人才知情。