《沙娜拉传奇第二季》故事时间起始于一年后，安柏丽已与艾尔奎斯树合为一体，精灵王伊凡丁已死，他的儿子安德（Aaron Jakubenko）继任为王。新出现的魔法令人们感到恐惧，一个自称「腥红」的组织四处追杀魔法师和术士，利用恐惧挑拨各种族之间的矛盾。威尔（Austin Butler）仍在为失去安柏丽而感到痛苦，他决心忘掉自己的魔法背景，安安心心做一名医士。一个叫马雷斯的女孩从「腥红」组织的攻击中救了他一命，他不得不再次加入对抗邪恶力量的战斗。