2004年,执导由李康宜主演的剧情短片《神奇洗衣机》 ,该片获得第40届台湾电影金马奖最佳短片奖 。2006年10月9日,自编自导的爱情奇幻电影《人鱼朵朵》上映,该片叙述了一个爱鞋成痴的女孩朵朵,追求白马王子与自己梦想的爱情故事 ,入围第10届釜山国际电影节主竞赛单元-新浪潮奖 ;同年,执导由李国毅、唐振刚共同主演的剧情电影《极限烫衣板》。
2007年,自编自导由关颖、何润东、余男联袂主演的爱情喜剧电影《基因决定我爱你》 。2008年,执导由郑元畅、张钧甯等合作主演的爱情剧《蜂蜜幸运草》 。2010年10月29日,由其执导的爱情电影《背着你跳舞》在台湾上映,该片由徐若瑄、杨佑宁、黄晓明等联合出演 。
李芸婵在其电影的童话表达和视觉建构上表现出了极高的潜质和悟性。在她的电影中,对民间故事分类体系“AT分类法”中的“AT461型”民间故事进行了现代化的阐释,运用“童话化”的叙事策略弥合故事与现实之间的差距;借助视听艺术手法对经典童话借用、修改和片段化的使用,强化了其电影超现实主义的梦幻效果,给观众带来了一种观看电影的全新感受,也引发了人们对于现代都市人“幸福观”的思考。李芸婵电影的“童话化”不仅体现在对经典童话故事的挪用方面,还通过将多个童话故事进行多重嫁接、仿用体现出来。在与现实生活拉开距离的同时,电影文本消解了情节跳跃所造成的逻辑问题 (《当代电影》评)。