1999年,与让·德塞贡扎克联合执导电视剧《法律与秩序:特殊受害者第一季》。2000年,与彼得·劳尔、亚当·伯恩斯坦等联合执导电视剧《带糖的陌生人第二季》;同年,与蒂莫西·布斯菲尔德联合执导电视剧《艾德第一季》。
2001年,执导由里卡杜·达林、赫克多·艾戴里欧共同主演的家庭爱情电影《新娘的儿子》,影片讲述了已到中年的拉斐尔为完成父母的心愿重新帮他们在教堂举行一次婚礼的故事 ,入围第74届奥斯卡金像奖最佳外语片奖 ,获得第25届蒙特利尔国际电影节评委会特别奖。
2004年,由其执导的运动喜剧电影《阿维拉达之月》上映 ,该片获得第19届戈雅奖最佳西班牙语外国电影奖;同年,执导由休·劳瑞、丽莎·艾德尔斯汀等共同主演的悬疑剧《豪斯医生第一季》 。2006年,与杰斯·亚历山大、约翰·福滕贝里联合执导科幻剧《六度空间》;同年,与蒂娜·菲等联合执导电视剧《我为喜剧狂第一季》。
2009年,执导由里卡杜·达林、索蕾达·维拉米尔、帕博罗·拉格联合主演的爱情悬疑电影《谜一样的双眼》,影片改编自阿根廷作家爱德华多·萨切里的小说《他们眼中的秘密》 ,获得第24届戈雅奖最佳西班牙语外国电影奖、第82届奥斯卡金像奖最佳外语片奖 。
2013年,执导由鲁伯特·格林特、安东尼·海德参与配音的动画电影《挑战者联盟》,影片根据RobertoFontanarrosa的短篇故事《一位右前锋的回忆录》改编,讲述一名害羞而有天赋的男孩在“桌上足球”小人偶的帮助下战胜强大对手的故事 。
2014年,与拉尔沙·康达基、卡瑞恩·库萨马等联合执导电视剧《奔腾年代第一季》 。2015年,由其执导的电视剧《奔腾年代第二季》首播。2017年,执导由乔什·哈洛威、莎拉·韦恩·卡丽丝等联合主演的科幻冒险剧《殖民地第二季》;同年,由其执导的电视剧《奔腾年代第四季》播出。2019年,执导由格拉谢拉·博尔赫斯、奥斯卡·马丁内兹共同主演的喜剧电影《Elcuentodelascomadrejas》。
阿根廷导演胡安·何塞·坎帕内利亚的事业历程有些类似于李安,也是用好莱坞喜欢的手法讲本国独特情感的高手。他更像是一个在自己的领地求学有成,在自己的市场里浸染出来的嫡系力量。在电影《谜一样的双眼》中,他拍出了一部令人目不转睛的影片——影片中有复杂的故事和纠结的情感。为了保证在视觉表现上青出于蓝,坎帕内利亚安排了一个让人叹为观止的长镜头 。而且,该片视听语言考究,时空转接过渡自然,结尾处的悬念设计更是全片的点睛之笔,带给观众以极大的心灵震撼。它打破了整体简单、质朴、内敛的影片基调,不但体现了编导胡安·何塞·坎帕内利亚布局谋篇的独具匠心,也激起观众强烈的情感体验 (《南方人物周刊》、《电影文学》综合评)。