艾伦·吉尔伯特

而作为与吉尔伯特渊源最长久的纽约爱乐乐团，也在2001年对其伸出了橄榄枝——自2001年首次指挥，到2007年，作为客席指挥的吉尔伯特已经37次指挥这个美国最富盛名的交响乐团。2007年年底，乐团方面正式决定由吉尔伯特接替年迈的著名指挥马泽尔出任乐团音乐总监——这也是乐团方面自指挥巨匠伯恩斯坦之后的又一位美国本土音乐总监，也是第一位纽约土生土长的音乐总监。

吉尔伯特与纽约爱乐乐团经理

除担任纽约爱乐乐团音乐总监之外，吉尔伯特目前还担任北德意志广播交响乐团（NDR）的客席指挥（2004年起）。2008年，吉尔伯特还在大都会歌剧院举行了首演，指挥约翰·亚当斯的先锋歌剧《原子博士》，受到了广泛好评。

吉尔伯特所指挥的《原子博士》曾被提名格莱美奖，其指挥的马勒第九交响乐被著名的《留声机》评为上佳版本。2010年5月，吉尔伯特获得柯蒂斯音乐学院荣誉博士头衔，另外自2011年起，吉尔伯特被任命为茱莉亚音乐学校的下一任指挥专业的负责人。