春秋战国时期，一位叫秦越人的医生，因医术高超，被百姓称作传说中的神医扁鹊。他本有一个幸福的家庭，但为了求得真正的医术，常年背井离乡周游列国于民间行医。他在虢国治好了太子的病。巫祝买通骑士暗杀扁鹊，老石公挺身相救让扁鹊免于一死。齐桓侯召见扁鹊时被他断定患有重疾，可是齐桓侯讳疾忌医，不肯治疗，结果死去。太医却因此反诬扁鹊，害死了扁鹊的夫人，又和巫祝联手害死了扁鹊。扁鹊的义子子豹又背起扁鹊的药囊，踏上了艰险的医学之路……