一切似乎都归于平淡，Chuck将Intersect取了出来，他的父亲，传说中的Orion也毫发无伤的从Fulcrum的基地中成功逃出。坏人邪恶的计划被阻止，一对有情人也终于要步入婚姻的殿堂。但是，一切真的会顺利地进行下去么？本季的大结局，Chuck和他身边的朋友，战友，亲人，爱人，都将何去何从？…

　　因为Chuck近期越来越难以控制的表现，将军下令将Chuck带到安全基地看押。作为Chuck最信任的人，原本事业第一的Sarah违反了命令，私自将Chuck带走，并试图协助他找回父亲。同时，Casey接到命令，必须不惜一切代价，将私自逃走的Sarah和Chuck抓回，死活不论。在这关键的时刻，Chuck能否顺利救出父亲，他和Sarah的感情又会有什么样的发展，貌似冷血的Casey会帮助他们，还是服从命令呢？　　Morgan中了Emmett设下的圈套，在毫不知情的情况下帮助了Emmett将“大麦”踢下了Buy More的店长宝座。面对Emmett节节进逼的威胁和Big Mike的尴尬处境，Morgan将如何选择才能对得起自己的良心呢？…

　　Chuck的父亲被Fulcrum抓走，为救父亲，不再相信NSA和CIA的Chuck决定用任何可用的方法，不择手段的找寻父亲——他准备和前女友，正在坐牢的Fulcrum特工Jill合作，以她的自由交换父亲被囚禁的信息。Jill会同意这项交易，Chuck能够找到自己的父亲么？　　Buy More总部将派人前来检查这段时间Emmett的工作成效，为了与Emmett对抗，众店员在Morgan的带领下展开了一系列的动作。面对这样的不合作行为，Emmett与Morgan私下达成了貌似互利的协议。只是，事实真的如此么？…