刘兰芝的生日宴，她收到了很多贺礼，陈深立刻帮忙着把礼物送上楼。刘兰芝很感慨地跟陈深谈起了妞妞，忍不住拿出她的照片来看，毕忠良见到后特别紧张，立刻把刘兰芝和陈深叫下了楼。
徐碧城久未联系陶大春，陶大春认为她是背叛了军统跟陈深好上了，于是把徐碧城给找了出来，拦住了即将离开上海的徐碧城。徐碧城求陶大春放过她，让她离开，陶大春表面上答应，趁徐碧城不注意把她给打晕了带走。
阿达跟刘二宝打牌的时候，无意间把陈深和徐碧城打手语的事说了出来，正好被毕忠良给听到了。毕忠良马上下令，把车开到他家门口，把所有人都召集到行动处，然后跟刘兰芝找了个借口就立刻回行动处。
陈深让扁头帮忙，帮他混进行动处去，然后让扁头去火车站等朱珠，跟她一起离开上海前往嘉善。扁头安全离开之后，陈深便进了毕忠良的密室，打开箱子找归零计划。箱子里什么也没有，而旁边却放了妞妞的照片，陈深立刻想到刚才毕忠良看到妞妞照片时的紧张，于是急忙离开了行动处。
毕忠良回到行动处，知道扁头来过，马上带人在行动处上上下下找了起来，这时皮蛋把炸弹不断地扔进行动处，行动处乱作一团到处都是火苗和浓烟。陈深返回了毕忠良家里，怂恿刘兰芝带着一帮太太去看电影，然后直奔毕忠良的书房。
刘二宝在毕忠良开车回家后，打电话联系了李默群支援，李默群让刘二宝联系瘸子到毕忠良家埋伏，无论是陈深还是毕忠良，只要谁想拿走归零计划都格杀勿论。陈深拿到了归零计划，毕忠良就在楼下等着他，质问他究竟是否是麻雀。
刘兰芝突然回家，陈深趁机夺走了毕忠良手中的枪，可没想到枪里根本就没有子弹，结果他被毕忠良开了一枪。刘兰芝不让陈深杀毕忠良，同样也不让毕忠良杀死陈深，她坚持挡在陈深的面前，求毕忠良放过陈深。
就在陈深离开之时，毕忠良发现了埋伏的瘸子，为了救刘兰芝他被瘸子一枪打死。瘸子开枪后，陈深马上拿起毕忠良的枪，杀死了瘸子，然后将所有真相都告诉快死的毕忠良。行动处的人包围了毕忠良家里，陈深将归零计划交给汪姐后，带伤开车引开行动处的人。
陈深被李默群拦住了去路，他把归零计划扔了出去，徐碧城趁乱杀了刘二宝，让陈深有机会开车逃跑，结果撞车炸了整辆车。徐碧城被孙秘书抓住了，正准备送她上路之时，陶大春赶来救徐碧城。
几个月后，陈深回到了延安，见到了所有人却没有见到徐碧城。1946年冬，陈深给在教堂的刘兰芝送药，不见她一面就悄然离开了，然后继续在上海做地下工作。
就在陈深与春羊接头，将麻雀任务交给她之时，潜伏在保密局的徐碧城带人到米高梅抓拿麻雀，她远远看着陈深离开后，替他制造混乱。（完结）
…
苏三省逃跑，毕忠良又将他当成共党，汇报到了影佐那里。影佐不相信苏三省是共党，认为是毕忠良想要苏三省的命，李默群也想置苏三省于死地，便在一旁帮腔，建议影佐将苏三省抓回来一问究竟。
毕忠良派陈深去抓苏三省，陈深则借着毕忠良不信任他的事做文章，想要撇清与毕忠良的关系，不想出面。毕忠良求了陈深半天，陈深勉强答应，看在刘兰芝的面上，去抓苏三省回来。
苏三省跑到一户人迹罕见的人家家里偷吃的，结果没想到让他意外碰到了昌隆饭店的程青山，他逼问程青山说出实情，程青山不肯，苏三省则把他的妻子给杀了。苏三省开枪，惊动了陈深他们，苏三省只能带着程青山逃跑。
程青山被苏三省抓到，陈深明白，他的身份即将暴光，而他的归零计划还没有拿到，只得坚持下去拼个鱼死网破。苏三省把程青山关在六大埭仓库，然后故意在刘二宝他们面前出现，被刘二宝逮捕。
苏三省告诉毕忠良，他掌握了确凿的证据，因为他已经抓到了昌隆饭店的老板程青山，可以证明陈深就是共党。苏三省不肯说出程青山的下落，毕忠良看了地图认为程青山就被藏在六大埭仓库，所以马上派人去了那里。
找到了程青山，毕忠良便逼问他当天发生的情况，程青山让毕忠良给他松绑，然后便抓着陈深，指责他害得自己家破人亡。陈深告诉程青山，他的儿子还活着，程青山才松了一口气，然后帮着陈深把戏继续演下去，制造成他是受苏三省胁迫要陷害陈深的。
程青山演完戏后，便想杀了苏三省报仇，结果被苏三省打死了，临死前他暗示陈深，替他照顾他的儿子。毕忠良相信是苏三省故意陷害陈深，他把苏三省交给陈深来处理，陈深给苏三省扎了一剪刀后便离开了，让苏三省被阿四咬死。李默群和毕忠良共同汇报了苏三省一案，虽然影佐清楚结案词里的未必是真相，但他也只能默许认可那就是事实，将一切了结。
归零计划将在十天后启动，陈深不得不抓紧时间，尽快盗取归零计划。毕忠良要去特工总部开会，陈深立刻抓准了时机，在他离开之后，拿着刘兰芝的药进了毕忠良的办公室，没想到却意外地发现了毕忠良办公室里的密室。
毕忠良一回办公室，便进了密室，结果发现有人进过密室，他马上打电话给牛科长，这才知道陈深进过他的办公室。陈深配好了钥匙，准备在刘兰芝生日那天，找到毕忠良藏着的归零计划。…
陈深去向毕忠良借人，要去把皮皮找回来，而毕忠良则把行动处抓到共党的事告诉陈深，让他帮忙处理一下。毕忠良告诉陈深，庞勇被捕而皮皮又失踪了，他认为皮皮与中共的回家计划有关，陈深只好要求自己去审一审庞勇。
陈深要审庞勇，让毕忠良更加怀疑，他只得先拖延陈深审庞勇的事，然后让刘二宝去处理掉庞勇。交代刘二宝后，毕忠良便去见苏三省，要求他跟自己合作，引陈深上钩，查清楚究竟陈深是不是共党。
陈深准备去审庞勇的时候，庞勇正好咬舌自尽了，这不得不让陈深开始怀疑庞勇的身份，于是若无其事的跟刘二宝打听了起来。庞勇被救后脱离了生命危险，刘二宝立刻去威逼主治医生，让他对外一律宣称庞勇是咬断舌头的而不是被刀割掉的。
汪姐在街上寻找皮皮的时候，遇上一个男人在看寻人启示，她便上前问了一下。由于对方描述的小孩情况和皮皮很相似，汪大姐确信那个孩子就是皮皮，她马上打电话通知陈深来商量救皮皮。
苏三省安排阿顺，把皮皮带到秋风渡他们安排好的住处，等有人上门来救皮皮。汪姐去秋风渡打听，相信了苏三省透露的消息，皮皮就被藏在那里，她马上回去找陈深。苏三省看汪姐中计了，马上通知毕忠良，让他安排狙击手给自己，他确信毕忠良安排的那个狙击手肯定就是打伤他和杀死苏姐的那个人。
毕忠良让刘二宝通知瘸子，去苏三省那里复命，无论陈深是不是共党都不准瘸子杀了陈深，要把陈深带回来给他审。陈深特意去看刘兰芝，把有皮皮的消息告诉刘兰芝，然后替刘兰芝带点饭菜去给毕忠良吃。
刘兰芝想知道毕忠良有没有吃了馄饨，正好从扁头那里知道，陈深去秋风渡救皮皮，所以刘兰芝也马上跑了过去。陈深进了屋，敲门索要皮皮，与阿顺纠缠了起来，皮皮趁机爬窗求救，正好被前来寻找皮皮的刘兰芝发现了。
刘兰芝不顾一切的上楼救皮皮，看到皮皮被阿顺挟持着，她非常的担心只得承认自己就是中共，让阿顺放了皮皮。苏三醒听到刘兰芝承认是中共，终于抓住了机会，让瘸子开枪杀了刘兰芝报仇，阿强想要阻止结果被苏三省给杀了。
徐碧城发现了苏三省的车，知道秋风渡有埋伏，立刻跑回去想通知陈深，正好看到瘸子的枪，她来不及救陈深，只得向瘸子开枪，这才让瘸子打偏了，只伤了刘兰芝的手臂。毕忠良知道刘兰芝去了石库门，马上带着行动处的人前来，结果还是来不及救刘兰芝，一怒之下他便杀了阿顺，然后去找苏三省算账。
苏三省要将刘兰芝当成共党分子，毕忠良明白苏三省借机报仇，只能杀了苏三省，可没想到苏三省太警觉逃跑了。…
