海隆号舱内的氧气就快消耗完尽，操作系统失去控制，不断触碰到海底礁石，将叶晗和张西洋等人折磨的精疲力尽。此外，周局指挥专案组的人尽全力抢救海隆号，解救张西洋等人。洪少秋恢复系统文件还差最后一步，指挥系统修复，在黑客尸体内找到了微型干扰器，如此一来黑客被击毙就是高一天等人故意而为之，肖卫和队友正全力以赴搜寻高一天的踪迹。

氧气即将消耗殆尽，洪少秋等人还在尽力而为，叶晗等人的性命危在旦夕，拯救海隆号人员的任务迫在眉睫。洪少秋和米小冉通力合作，在最后一刻完成了修复系统的漏洞，马不停蹄奔赴前线。海隆号舱内，张西洋和商菲菲等人缺氧晕厥，叶晗还在强撑，洪少秋和米小冉来到指挥处，默契配合传输数据至海隆号系统，想要抢修海隆号，氧气只剩下百分之十，他们在跟时间赛跑。米小冉切换了通道，想以更快的速度和海隆号取得联系接触危机。

上传终于完成，海隆号已经撑到了极限，洪少秋呼叫海隆号，然而舱内并无一人回应，所有人心情沉痛。叶晗一番喘息之后发出最后的求助，新的氧气开始供应，张西洋等人暂时安全，洪少秋才算松了一口气。周局命令张西洋等人休整之后尽快返航，叶晗服从指挥，一切好在有惊无险。大秦在华西山路发现了高一天的踪迹，高一天私自给洪少秋发了信息，让他单独来赴约，洪少秋救妹心切不顾一切去赴约。海隆号恢复了正常，张西洋等人正在返航。大秦和国安的人围堵了高一天的车，然而里面的人却不是高一天，他只是高一天的托来引开国安的视线。高一天往北坦老街逃跑，那里是监控盲区，周局命令全队搜捕高一天。

洪少秋故意绕进了监控盲区，他要一个人去救无辜的妹妹张妍，虽然危险，但他还要拼力一搏。海隆号返航回陆，叶晗看见米小冉安然无恙，心里总算踏实。周局告诉叶晗，洪少秋去完成后续的任务了，叶晗担心洪少秋会有危险，她知道洪少秋绝不会这样铤而走险，决定去寻找沿路的线索。

洪少秋来到一片茂密丛林，远远地看见张妍被绑在高处，洪少秋冲上去想要唤醒张妍，却被躲在森林密处的高一天安排的杀手射击导致腿部中弹。高一天吐露真实身份，他就是国安辛苦追寻的比目鱼，高一天和洪少秋打赌游戏，他在张妍脚边放了有容量的器具，并在偷偷地放张妍身上的血，现在洪少秋需要在规定时间内找到解救张妍的办法，否则张妍将失血过多而死。高一天是怀着仇恨来对付洪少秋的，八年前洪少秋亲手抓了渔翁，高一天的出现就是要替老师渔翁报仇，洪少秋想要上前，却又被射击中弹，手臂受伤。

此刻，叶晗正在搜查洪少秋的路线，并且命令肖卫调取出所有渔翁的资料。正当洪少秋和高一天周旋时，叶晗带着国安的人赶到现场，江源正在暗中观察对方狙击手的坐标。为了引出高一天的狙击手，洪少秋孤注一掷朝张妍走去，叶晗只能在背后眼睁睁地看着他身处危险之中。洪少秋背起昏迷不醒的张妍返回，步履维艰，所有人都不敢有丝毫松懈，江源发现了高一天的狙击手，叶晗下令击毙，洪少秋和张妍终于安全，叶晗让国安队员护送洪少秋和张妍离开。

洪少秋忽然回想起米小冉日前见到的小丑，他知道叶晗很有可能出现危险，便拿着枪冲进丛林。叶晗小心翼翼搜索，却被小丑挟持，洪少秋从背后突袭击毙了小丑，叶晗也被人从背后打了一枪受伤。高一天受伤向恩维斯求助，恩维斯却出尔反尔违背和高一天的承诺，现在只剩下高一天一个人搏斗。洪少秋在海边悬崖追上高一天，身负重伤的洪少秋对高一天不具任何威胁，高一天抢过了洪少秋手里的枪，准备伤害他，叶晗及时赶到制服了高一天，洪少秋重伤昏迷。洪少秋从昏睡中醒来，叶晗和他都大难不死，真凶终于伏法。

301案件到此终于落幕，众人都不禁在心里送了口气。海隆号的下水实验成功，国安的人也立了大功。案件结束之后，叶晗就离开了三岛市，离开之前，洪少秋和叶晗的感情也有了巨大的进展。

一年后，叶晗所在的省市发生了多起重大泄密案件，上司要求成立专案组，三十天破案，还特地为叶晗请了两个帮手。叶晗和米小冉拒绝，她觉得自己有能力完成。两个帮手到了之后，叶晗哭笑不得，门外站的俨然是洪少秋和江源。时光彷佛回到一年前，这一切都是缘分。

洪少秋在会上做出了大胆的假设，从刘子岸的死到郑婉芝的落网，这冥冥之中似乎有人在操纵，目的就是为了让所有人误以为案子已经结清，这样的话，对方的目的才能达成。洪少秋想要将计就计，在内部做出总结，让敌人误以为我们中了计，然后我们暗中撒网，将敌人一网打尽。这个提议很危险，周局很是犹豫。叶晗原本是反对洪少秋的提议，可是现阶段没有任何可行的好办法，只有暗中撒网才可能有一线生机，所以一番思虑之后叶晗同意了洪少秋的建议。

叶晗询问洪少秋对于高一天的想法，洪少秋直接将辛苦搜出的坐标交给周局，周局下令让国安人员全力找出幕后真凶。江源气喘吁吁地赶来报告，米小冉已经度过了危险期，已经清醒了，但是什么时候能够完全康复还需要再观察情况，叶晗鼓励米小冉一定要挺过来和她们一起战斗。江源日以继夜地照顾着米小冉，呵护备至地照料证明了他对米小冉的情意。

国安人员查到郑婉芝就是寄信给国安报告钱守成行踪的人，而且被狙击的杀手身份也已经证明，但是很有可能只是对手精心布局的诱饵，现在国安的人依旧不能放松警惕。洪少秋从海底打捞上来了坐标器，这个就是能够窃取海隆号数据的仪器，为了安全起见，洪少秋申请进入海隆号。

洪少秋申请进入海隆号，技术处临时赶制出了一款反干扰装置，一个装在指挥室，另外一个要装在有干扰源的地方，这两个装置配合起来就可以临时破坏有可能存在的敌方设备。反干扰设备是实时设备，必须人工操作，所以不能直接放入海隆号。周局拒绝了，洪少秋没有下水的经验。叶晗提出申请进入海隆号，她是技术精英，而且陆地上还有两个不定因素等着洪少秋去对付。叶晗的强势让洪少秋无力反驳，周局也接受了叶晗的提议。

301研究所的重要人员全部整装待发去进行海隆号试水，洪少秋和江源也在暗中跟进情况。肖卫目前没有发现公共海域的异常，叶晗叮嘱他盯紧陆地，防止高一天有动作。张妍和高一天出发前往海隆号试水实验，张妍是负责海隆号智能系统的工程师，对于高一天的野心她还没有任何防备。

张西洋和商菲菲，刘进三人启动了海隆号系统，叶晗带着稳定性的反干扰设备一起下水。洪少秋叮嘱叶晗注意安全，海底不可控因素太多，她必须保证自我安全，叶晗让他放心。总装下水之后，一开始一切操作都十分顺利，海隆号第一阶段潜入3000米，叶晗和地面随时保持实时通讯。指挥所呼叫海隆号传回数据，不料肖卫发现强烈干扰信号，而且就出现在海隆号上，洪少秋责令想尽一切办法联系上海隆号。之后通讯设备失灵，卫星信号也被屏蔽，连国安指挥系统也被攻击了，海隆号和指挥台断了联系，情况不容乐观。

操作系统无法控制，海隆号不受操控地继续下沉，一直下到5000米，这个深度消耗氧气十分厉害，海隆号舱内的氧气供应量只能维持四个小时。叶晗查到了海隆号上的干扰源，那就是高一天在张母宴会那天偷偷溜进海隆号仓库安装的干扰装置，此时洪少秋也得知高一天带走了张妍，命令肖卫全力追查高一天下落。叶晗冷静之后和刘进配合通过T96系统联系上了洪少秋，让他屏蔽干扰装置，然而海隆号实验数据正在被窃取，洪少秋当务之急是想办法组织数据外泄。海隆号的智能系统还没有修复，张妍此刻失踪更是火烧眉毛，众人心急如焚。

商菲菲指示洪少秋去智能系统办公室通过代码找到海隆号原文件既可以力挽狂澜，米小冉支撑着身体赶来帮忙。经过一番修整后，米小冉努力恢复了智能系统，然而没过多久，数据文件就开始自动删除，洪少秋冷静处理，阻止了病毒入侵，

睿智的头脑让米小冉等人折服，洪少秋让她尽快找电脑系统漏洞，同时，肖卫也来到停尸房查验黑客的身份。

郑婉芝在家里回想着高一天的话，打开神秘字条，在网上点开租房的网页，国安的人员时刻监视着她的一举一动。郑婉芝拿出收藏的旧照片，并且比对字典上的文字，翻译过来的谜语就是：刺杀工程师。国安人员发现郑婉芝只是上的普通网站便没有多疑。

叶晗和洪少秋在朝夕相处的过程中产生了深厚的感情，明天就是海隆号项目的完工仪式，301所有重要的领导和工程师都会到场，一切都该划上一个圆满的句号。第二天，张西洋和刘进，商菲菲等人出席海隆号新型深潜机竣工典礼，陆所长决定给301的研究人员举办一个小型庆功宴。张西洋提议宴请所有人员去自己家庆功，加上张母生日会，正好蹭蹭喜气。张母心花怒放地来到药店，郑婉芝假装没事人一样，张母邀请她出席自己的生日会，这对郑婉芝来说是个难得的机会。

肖卫查到了三位非法入境人员的资料，查到他们背后的老板就是代号渔翁的神秘人物，他创办的菲舍尔集团就是现在的K集团，而他们的头目也更换成了比目鱼。洪少秋早就耳闻比目鱼大名，他刚刚上任就派来三员大将，说明他的目标非常明确。叶晗接到通知明天海滨度假酒店午宴301所有重要的领导和工程师都会到场。洪少秋凭借当年捕捉渔翁的密码本破解了郑婉芝昨晚浏览网页的怪异行为，知道郑婉芝收到的神秘任务是刺杀工程师。叶晗布置人手潜伏宴会场地，郑婉芝就是他们最大的漏网之鱼。

宴会正式举行，叶晗暗中监视郑婉芝的举动，郑婉芝知道国安的人在监视她，故意扰乱她们的视线。洪少秋还没有到达会场，他始终不放心高一天，于是私下跟踪高一天。张母忙得手忙脚乱，国安的人随时随地都在保护她。张西洋招呼客人，商菲菲也来到会场，被张妍拉去摆花。高一天出门，洪少秋命人暗中调查他的行踪，实际上真正的高一天却在海隆号仓库附近蠢蠢欲动。

郑婉芝和商菲菲攀谈，把她支开了放酒的房间。国安的人早就在酒房里安装了监视器，郑婉芝开始行动，在酒里动了手脚。叶晗让国安人员化装成记者采访郑婉芝，吸引她的注意。而同时，高一天混入了海隆号仓库，套取了里面的资料，不料他离开时不小心碰到了钢管，惹来巡视人员注意，最终却还是被他逃脱。洪少秋也在继续跟踪替身高一天，而此时小丑也准备展开行动。

高一天带着礼物来到会场，洪少秋紧跟着到来，叶晗通知洪少秋郑婉芝已经采取了行动。郑婉芝将有问题的酒放在会场桌上，叶晗让国安人员掉包拿来检验。郑婉芝和高一天照面，握手之际高一天偷偷给了郑婉芝东西。郑婉芝来到酒房准备拿出东西动手脚，没想到洪少秋突然进来打断了她的计划。张母和张西洋是宴会的主角，所有人都在为张母庆贺，宴会一片祥和气氛，唯独郑婉芝心事重重。情到动人之处，张西洋热泪盈眶，301的研究成果海隆号项目来之不易。

郑婉芝悄悄倒掉了酒杯里的白酒，神色慌张地离开。郑婉芝脸色惨白，国安的人将她带走，大秦发现郑婉芝手掌心有乌青，原来她早就中毒，叶晗命令大秦立刻将她送往医院。高一天在会场上当中宣布和张妍的婚事，并送给了张父张母贵重的礼物。张母嘱托高一天认真对待张妍，高一天当中宣誓会保护好张妍，洪少秋让队友宴会结束之后检查高一天赠送的手表和项链，他不相信高一天。

大秦送郑婉芝去医院，情况不容乐观，叶晗通知洪少秋安顿好张父张母之后立刻赶往医院会合。高一天的手表和项链没有问题，但洪少秋还要继续检查。郑婉芝抢救回来，但是她中的剧毒会侵害她的生理系统，能不能录口供还很难说。奇怪的是她所中的毒是一种稀有的物品，洪少秋怀疑是会场里的人给她的毒药，郑婉芝是一个长期潜伏在三岛市的间谍，这背后肯定是有人想要故意加害于她。洪少秋大胆假设，是她在喝了第一杯酒之后，然后有人给了郑婉芝暗号让她完成自杀。