据传在三亿年前的远古时代，生活着神秘的神奇宝贝--灭世虫盖诺赛克特，它们堪称实力强劲的猎手。暗中活动、时刻谋划征服合众地方的等离子队无意间发现五尊盖诺赛克特的化石，他们利用先进技术对其予以改造和复原。远古的神奇宝贝重获新生，而它们最终从等离子队的控制下逃脱。